Jumperus,Посмотрите описание -
USBDeview.chm.
Disable/Enable/Remove Command-Line OptionsStarting from version 1.20, you can also use the following commands to disable, enable or remove USB devices from command-line:
...
/remove_all_disconnected - Remove all disconnected USB devices.
Пример команды
C:\util\usbdeview\USBDeview.exe /remove_all_disconnected
должно получиться желаемое.
Можно сделать командный файл и скопировать в автозагрузку или в планировщике настроить выполнение команды.